人体微生物三代宏基因组测序

    宏基因组学（Metagenomics），是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象，采用新一代高通量测序技术，获得环境微生物基因信息总和，研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等。宏基因组测序摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制，直接提取环境样本DNA 进行测序，具有通量高、速度快、信息全等特点，在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘更多基因资源方面具有很大优势，基于测序技术和生物信息学的快速发展，宏基因组技术优势在微生物研究领域中愈发明显，应用范围愈发广泛。

    目前，大部分宏基因组研究中使用了二代测序技术，其较低的成本可以满足大多数科研工作者的要求。然而，二代测序读长短的劣势在面对复杂微生物群落时显得十分明显。PacBio SMRT测序的长读长可以减少部分拼接错误，有效提高微生物群落鉴定的分辨率。