真核转录组测序

  转录组是指在某一特定发育时期或者某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括mRNA、non-coding RNA、rRNA 和small RNA 等。转录组学,是一门在整体水平上研究细胞中所有基因转录及转录调控规律的学科。转录组测序也称为RNA-Seq技术,可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs)、完善和优化基因结构、鉴定可变剪接体、RNA编辑等生命科学的重要问题。菲沙基因可以为您提供全面的转录组测序服务,以及专业和定制化的生物信息学分析服务。

  转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态或生理环境下所能转录出来的全部RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA两种,是基因功能及结构研究的出发点。通过新一代高通量测序,我们能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,从而可以快速高效研究生物差异基因的表达、可变剪切形式等生命现象。目前,转录组测序已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

  项目流程(参照如下)

  信息分析(参照如下)

  交付结果

  数据:按照Fastq等国际公认的数据格式进行存储,被大多数软件支持,方便后续分析

  报告:详细的统计图表和方法描述

  我们的优势

  提供权威的实验设计咨询,减少项目设计偏差

  海内外知名的生物信息专家,确保数据分析质量

  英文母语写作优势,助您快速撰写高质量论文

  原核转录组测序

  原核转录组针对原核微生物,用新一代高通量测序技术对该物种的特定组织或细胞进行转录组测序,与参考基因组比较,可以得到基因表达差异、GO功能分类、以及代谢通路分析等信息。原核转录组测序通过对原核total RNA样本去rRNA后进行文库制备,采用Illumina公司高通量测序平台测序,通过信息分析,可以获得基因表达差异信息、SNP分析、预测新转录本等信息,这为研究基因的结构和基因的表达调控提供了一个重要的手段。

  原核链特异性全谱转录组测序通过对原核total RNA样本去rRNA后进行文库制备,采用Illumina公司高通量测序平台测序,通过信息分析,可以确定一条转录本是来自正义链还是反义链并且可以确定转录本的边界,能比普通转录组更精确地统计转录本的数量,还可同时可以挖掘non-coding RNA的信息,这为研究基因结构和基因表达调控提供了技术支持。菲沙基因可以为您提供普通原核转录组测序、特异性全谱转录组测序以及sRNA分析。

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  升级版数字基因表达谱

  升级版数字基因表达谱(RNA-Seq(quantification))是用来研究某一生物对象在特定生物过程中基因表达差异的技术,该技术结合了转录组测序建库的实验方法与DGE(Digital Gene Expression Tag Profiling)的信息分析手段。可广泛应用于生理调控、农业性状、生物标记、环境改造、疾病机制和药物筛选等领域。

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  小RNA测序

  小RNA存在于真核生物细胞核和细胞质中,在细胞的生命活动中起着重要的作用,它作为一类重要的体内调节分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA.小RNA的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,进而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。小RNA测序技术采用胶分离技术,收集样品中18-30/40nt的RNA片段,利用高通量测序技术,可以一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息。依托于先进的生物信息分析平台和测序手段,鉴定已知小RNA,并预测新的小RNA及其靶标基因成为研究热点。目前,菲沙基因提供HiSeq 2500 Small RNA测序和信息分析服务。

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