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比较基因组分析—识别线虫睫状肌和纤毛疾病相关基因

浏览次数: 日期:2016年1月21日 16:06

材料:C. elegansC. briggsaeC. remanei的基因组序列

研究策略

C. elegansC. briggsaeC. remanei的基因组进行比较基因组分析,对线虫启动子区域具有典型X-box序列的基因进行筛选,同时对部分基因进行表达分析。

研究结果

u  识别了93个编码C. elegans纤毛的预测基因,其中1/3为已知的X-box调节基因;

u  绝大多数候选基因发生突变后会引起染料充盈缺损现象,而线虫的93个候选X-box条件基因中,有83个具有人的同源基因,这些信息日后可能可以用于纤毛病变病人的筛选鉴定;

u  依据Dyf表型、纤毛基因的功能特征以及线虫基因组信息,成功克隆了dyf-5基因并至少发现了一个dyf基因,新克隆的dyf-5基因可能是一个尚未明确的人纤毛病变症BBS的同源基因,或其它纤毛病变相关基因;

u  芯片数据分析识别了466 daf-19调控基因,466个基因中有很大一部分基因的启动子区域没有X-box模体,并不一定直接受DAF-19的调控。

识别X-box调控基因以促进线虫染料填充缺陷的基因dyf-5的克隆

菲沙基因相关文献

1.Chen N, Mah A, Blacque OE, Chu J, Phgora K, Bakhoum MW, et al.  Identification of ciliary and ciliopathy genes in Caenorhabditis elegans through comparative genomicsGenome Biol. 2006;7(12):R126.

所属类别: 菲沙成果

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