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比较基因组分析—线虫化学感觉基因家族的鉴定

日期:2016年1月21日 16:04

材料:C.elegansC. briggsae基因组数据

研究策略

使用比较基因组学的方法挖掘线虫的特定基因家族。

研究结果

u  线虫的化学感觉基因家族srabC. elegans25个基因,C. briggsae14个基因,并对超过20%的化学感觉基因进行重新注释;

u Srab基因家族类似但又有别于早期发现的sra家族,和sra家族类似,在线虫中srab家族也展现出不同的扩张,线虫srabsra基因家族的扩张是由多轮串联重复和个别基因易位导致的;

u  对尾部的噬粒神经元和头部化学传感器神经元的Srab基因家族多个成员的细胞表达模式进行研究,显示srab基因确实是化学感觉基因,能够将化学感觉信号从线虫的头尾两端传入体内。

                                                                                            

        C. elegansC. briggsaesra基因家族的比较分析                       C. elegansC. briggsaesra基因家族的系统发育树

菲沙基因相关文献

1.Chen N, Pai S, Zhao Z, Mah A, Newbury R, Johnsen RC, Altun Z, Moerman DG, Baillie DL, Stein LD. Identification of a nematode chemosensory gene family. Proc Natl Acad Sci USA. 2005 Jan 4;102(1):146 -51.

所属类别: 菲沙成果

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