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华中科技大学郭安源教授访问菲沙基因

日期:2018年6月8日 17:11

6月6日,应菲沙基因组医学公司的邀请,华中科技大学生命科学与技术学院郭安源教授到访菲沙。菲沙基因组医学公司CEO李源、医学基因组事业部总监程艳兵等参与了接待。

郭安源教授为华中科技大学华中学者、学术新人奖获得者和教育部新世纪优秀人才计划支持者,主要致力于癌症等复杂疾病的生物信息学研究。本次到访菲沙基因,郭教授为大家带来了题为《转录因子与非编码RNA数据库、方法及其在癌症中的调控研究》的专题报告。着重对转录因子和转录因子靶基因数据库(AnimalTFDB,hTFtarget)、小RNA和长链非编码RNA以及单核苷酸多态性互作关系数据库(miRNASNP,lncRNASNP,HMED)等数据库的构建流程以及核心框架进行了讲解。同时,郭教授也介绍了由其实验室开发的用于癌症等复杂疾病数据分析的工具和平台,如SEGtool和GSCALite等。此外,郭教授结合临床项目合作经历,分享了运用微泡(Microvesicles, MVs)在白血病患者中,对转录因子-miRNA网络进行研究的案例,指出基因的差异表达在复杂疾病的发生、发展中的重要作用。

 

 

医学基因组事业部总监程艳兵向郭教授汇报了菲沙基因基于三代测序技术的医学科研应用方向,包括三代转录组测序在转录本的可变剪接、可变多聚腺苷酸化位点、RNA编辑等转录后加工修饰的检测,以及融合基因和长链非编码RNA鉴定中的应用优势。同时也介绍了三代基因组测序在人类结构变异检测、高重复/高多态性/GC异常区域的突变检测以及DNA甲基化修饰等方面的应用。另外,程总监也介绍了目前菲沙在临床检测产品上的开发和布局。

 

郭教授对菲沙基因组医学相关业务线的建立和发展表示了充分的肯定。围绕菲沙基因组医学的重要业务,双方就科研问题和项目合作进行了详细的讨论。郭教授表示愿意在复杂疾病科研项目合作以及数据库开发等方面跟菲沙基因展开广泛合作。同时,双方也就合作人才培养等方面进行了交流,菲沙基因将为华中科技大学有志于从事生物信息学相关研究工作的本科生和研究生提供实习实训的机会,推进校企培育人才的模式,共同促进生物大数据行业发展。

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