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首届三代测序技术精品培训班

日期:2015年8月31日 14:31

  测序技术发展至今取得了相当大的发展,从一代的Sanger测序到第二代高通量测序,到如今的第三代单分子实时测序,测序读长从短到长,测序成本也不断降低。2009年PacBio公司推出第三代DNA测序技术--SMRT(Single Molecular Real-Time sequencing),其超长读长以及高精确度使得复杂基因的从头测序工作成为可能。目前利用SMRT测序发表的论文已经超过50篇,成功的解决了包括基因组组装(Matthew P,2015),碱基修饰(John B,2015),转录组分析(Au,2014)等问题,随着三代测序技术的快速发展,其应用必将对基因组研究、疾病医疗研究、药物研发、育种等领域产生巨大的推动作用。

  今年9月开学季将由加拿大西蒙菲沙大学终身教授、生物信息学和基因组学专家陈楠生博士以及菲沙基因信息有限公司首席技术官Jeffery Chu博士等组成的顶尖技术团队带您一起揭开三代测序面纱。

  【培训时间地点】

  培训时间:2015年9月19-21日   培训地点:湖北省武汉市东湖高新区光谷生物城B8栋菲沙基因培训室

       【课程安排】 

日期 

    培训时间   

课程内容

   时长 

9.19

9:00-12:00

1、基于三代测序的基因组学研究
1.1 基因组学研究概述及发展历史
1.2 三代基因组 De novo测序及技术流程
1.3 基因组项目设计

3h

13:30-17:30


2、三代基因组实例分析
 

1.5h


3、软件介绍及上机操作
(SMRT、MHAP、Spades、PBJelly等)

2.5h

9.20

9:00-12:00


4、基于三代测序的转录组学研究
4.1 全长转录组学研究概论和前沿发展
4.2 三代全长转录组分析流程
4.3 转录组项目设计

3h

13:30-17:30


5、三代全长转录组实例分析
 

1.5h


6、软件介绍及上机操作(SMRT-Analysis Isoseq
 

2.5h

9.21

9:00-11:00


7、基于三代测序的碱基修饰研究
7.1 碱基修饰研究技术进展
7.2 碱基修饰芯片技术原理及流程介绍
7.3 碱基修饰实验数据分析

2h

11:30-17:30


8、上机操作数据分析及问题解答
 

5h

 

    注:为了提高培训效率,并让每一个学员能够掌握上机内容,每天均安排软件介绍和上机操作,最后在9.21号统一分析上机操作的数据,并解答出现的问题。

 

  【课程特色】

  1、 权威教授亲自参与授课,国际讲师团队,丰富的三代测序项目分析及开发经验;   2、理论+实践,上机操作、分析与解答,充分保证学以致用;   3、从基因组-转录组-碱基修饰,贯穿整个三代测序领域的研究进展、技术思路、分析方法和实例剖析,最后手把手带你上机操作,三天时间从零到掌握三代测序分析技术。

  【讲师介绍】

陈楠生  教授

    加拿大西蒙菲沙大学终身教授,生物信息学和基因组学专家,迈克史密司卫生研究基金会学者(MSFHR Scholar),加拿大卫生研究院新研究员,加拿大中国技术创业与创新协会副会长。陈楠生教授长期以来致力于癌症基因组突变研究,秀丽线虫基因组结构变异,疟原虫基因组的结构和功能,转录调控,基因相互作用网络等方面的研究。先后在Science、Genome Research、Genome Biology、PNAS、Nature Communication、Nature Neuroscience等国内外有影响力的刊物上发表60余篇SCI论文。

牟德宜

    美国加州大学戴维斯分校土壤微生物学硕士,现任Pacific Biosciences北亚区域总监,协调PacBio的销售渠道与关键客户。牟德宜女士有长达十五年的生命科学工作经验,有六年的高通量测序领域工作经验。在加入PacBio之前,牟德宜女士在Illumina、Applied Biosystems担任不同职位。
 

Jeffrey Chu 博士

    加拿大西蒙菲沙大学博士,英属哥伦比亚大学博士后,主要致力于破译不同诱变剂对基因组的影响及修复情况,肿瘤细胞的突变以及病原体的致病因子基因组学研究,先后在Nature Communication、Genome Research、Bioinformatics、Nucleic Acid Research等权威期刊发表SCI论文15篇。
 

付爱思

    武汉大学药学院硕士,武汉生物技术研究院基因测序平台主管。主要从事微生物、动植物、人类健康领域相关测序新技术的研究开发工作,参与的重大科研项目发表在Nature genetics,Nature communications等杂志上,实际参与三代测序项目上百个。

周 帆

    浙江大学生物信息学硕士,7年的生物信息分析经验。主攻三代测序相关的基因组学和生物信息学研究,主导完成的三代测序数据分析项目已达数十个,包括二、三代数据结合的大型动植物基因组De novo,三代全长转录组研究等,实战经验丰富。
 

王 成

    华中农业大学生物信息学硕士。专注于二代、三代基因组组装方向研究,先后完成多个动植物基因组和微生物基因组以及比较基因组等个性化研究项目,具有丰富的生物信息分析经验和项目经验。
 

刘红芳

    武汉科技大学数学硕士。主要从事三代全长转录组技术的研究开发工作,已主导完成多个动植物全长转录组项目,擅长将算法与生物信息学相结合,建立了三代全长转录组测序技术的分析流程。
 

 

  【收费标准】

  报名费3000元/人(含培训费、材料费、上机费、培训期间中餐费)  培训名额限50人,报名从速。

  【报名方式】

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