宏基因组测序

  微生物种类繁多,培养条件复杂。据统计现今只有1%的微生物可以在实验室进行纯种培养。宏基因组学是将环境样品中的微生物群落作为整体进行研究的学科。与其他研究环境群落的方法相比,宏基因组测序具有通量大、产出数据多、更为高效的优势。采用宏基因组测序的方法对微生物群落进行研究,不仅能够获得样本微生物物种的组成和丰度信息,还可以进行功能基因注释,获取样品间基因差异信息。菲沙基因利用高通量测序技术进行宏基因组研究,可以深度挖掘具有应用价值的基因资源,为研究和开发新的微生物活性物质提供有力支持。

  项目流程(参照如下)

  信息分析(参照如下)

  交付结果

  数据:按照Fastq等国际公认的数据格式进行存储,被大多数软件支持,方便后续分析

  报告:详细的统计图表和方法描述

  我们的优势

  提供权威的实验设计咨询,减少项目设计偏差

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  16S/18S rDNA测序

  16S rDNA是细菌分类学研究中最常用的“分子钟”,其序列包含9个可变区和10个保守区。其中,可变区因细菌种类而异,且其变异程度与细菌的系统发育密切相关。通过检测16S  rDNA的序列变异和丰度,可以快速了解环境样品中细菌群落多样性信息。目前该方法已经广泛应用在微生物分类鉴定、微生态研究等方面。

  相比之下,真菌可以采用18S rDNA测序的方法进行菌种鉴定。18S rDNA是真核生物核糖体小亚基对应的DNA片段,该序列中含有的保守序列可以反映生物物种之间的亲缘关系,而可变区域则可以反映真菌物种之间的差异。通过对真菌进行18S rDNA测序可以快速高效的对真菌进行鉴定分析。

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