中国是世界前列的渔业和水产养殖国家,丰富的水产资源是我国粮食的重要构成部分也是我国经济的巨大来源之一。开展水产基因组研究,可以帮助我们选育出更优良的水产生物品种,具有基础性的科学意义。同时,深入挖掘基因组信息,也将为水生生物基因组演化、性别决定及分化机制等理论研究奠定重要基础。
菲沙基因深耕水产研究领域多年,集成了先进的三代测序技术平台和三维技术平台,从数据产出到生物学问题挖掘,打造了水产基因组整体解决方案,已与众多行业专家合作并发表多篇高水平论文。2019年伊始,为了提供更加专业、准确的服务,菲沙基因特别聘任中国科学院水生生物研究所何舜平研究员加入公司。
3月15日,菲沙基因举行了2019年特聘专家聘任仪式。武汉国家生物产业基地建设管理办公室常务副主任钱德平出席本次会议并进行致辞,他对何舜平研究员的到来表示热烈欢迎,并对菲沙基因聘任何舜平研究员表示由衷的祝贺。仪式上,钱德平副主任与菲沙基因总经理陈东生先生一同为何舜平研究员颁发了特聘专家证书,聘任何舜平研究员为菲沙基因“水产基因组科学家”。何舜平教授对公司的成果与技术表示赞赏,他希望能够与菲沙基因联合开展更多鱼类基因组研究,为我国水产事业做出更大的贡献。
何舜平研究院简介
何舜平,男,1962年12月2日出生,法国国家自然历史博物馆理学博士。2003年国家杰出青年基金获得者、中国科学院水生生物标本馆馆长、中国科学院标本馆网络信息系统水生生物(海洋)中心主任。中国中科学院水生生物研究所、深海科学与技术研究所,中国科学院大学动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心研究员。博士研究生导师。中国动物学会理事,湖北省暨武汉动物学会理事兼副秘书长。湖北省科协第六届委员;任《中国动物志》编委,《生物多样性》学报编委,《水生生物学报》编委。先后主持和承担欧盟项目、国家自然科学青年基金、重点基金、杰出青年基金、国家863课题、973专题。并任中国科学院创新方向性项目首席科学家。
菲沙水产项目经验
菲沙基因拥有丰富的水产基因组项目经验,目前已完成多个物种的基因组项目研究,涉及鲶形目、鲈形目、鲤形目、中腹足目、柄眼目等。PacBio Sequel新版3.0试剂数据产出量,平均Subread N50达到25Kb,结合Hi-C技术轻松打造染色体级别高质量基因组。
菲沙水产文章成果
2018年9月,华中农业大学研究团队公布黄颡鱼的基因组,菲沙基因结合PacBio 和Hi-C技术提供了染色体水平的基因组组装服务。同月,浙江海洋大学研究团队联合菲沙基因基于PacBio Sequel对中国鱚鱼进行三代测序和组装,首次解析了中国鱚鱼全基因组序列信息。2019年2月,中科院海洋研究所团队发表条石鲷基因组,采用菲沙三代和三维技术平台构建染色体水平参考基因组,深入挖掘条石鲷的性别决定机制。
砥砺前行,不忘初心。菲沙基因愿意为水产领域研究者提供优质的三代测序组装和三维基因组服务,共同完成更多水产基因组研究,探索水产科学的神奇和奥秘,期待与您同行!
参考文献:
1、Gong Gaorui,Dan Cheng,Xiao Shijun et al. Chromosomal-level assembly of yellow catfish genome using third-generation DNA sequencing and Hi-C analysis.[J] .Gigascience, 2018, 7.
2、Xu Shengyong,Xiao Shijun,Zhu Shilin et al. A draft genome assembly of the Chinese sillago (Sillago sinica), the first reference genome for Sillaginidae fishes.[J] .Gigascience, 2018, 7: undefined.
3、Xiao Yongshuang,Xiao Zhizhong,Ma Daoyuan et al. Genome sequence of the barred knifejaw Oplegnathus fasciatus (Temminck & Schlegel, 1844): the first chromosome-level draft genome in the family Oplegnathidae.[J] .Gigascience, 2019, 8.