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再次突破!菲沙基因低起始量Hi-C建库降至200个细胞!

发布时间:2019-7-29 16:27:47阅读次数: 分享到:

        上个月,菲沙基因成功推出低起始量Hi-C建库,细胞量由万级别降低至千级别(5千),详情请回看:突破!菲沙基因低细胞量Hi-C强势来袭!。时隔仅仅一个多月,今天,菲沙基因再次突破,Hi-C建库起始量陡降至200个细胞。

        200个细胞是什么概念?掰着指头数都可以数完呀,小编怀着激动的心情,迫不及待地将这个好消息分享给大家。


        话不多说,咱们这次的分享,简单明了,我们仍以某动物细胞样本进行测试,分别对2万、2千、2百个细胞的起始量进行Hi-C建库,并进行小数据量测序评估文库质量,数据质控结果显示,三个文库均合格,有效数据率最高达67%,而200个细胞起始量的Hi-C文库有效数据率也达到48%,这个结果可是相当不错的呢~



        从互作图谱也能看出,染色体内互作明显,染色体间互作信号很少,结果也是棒棒哒~


低起始量Hi-C互作图谱(200个动物细胞)


        说到这里,你以为我们做到200个细胞就结束了吗?能不能更少?回答应该是可以的,虽然我们还没有继续测试,但是技术核心已掌握,再减少细胞量,我们相信也能成功。


        低起始量Hi-C文库构建方法,适用于特殊的来源有限的材料,比如某些动植物的配子、受精卵、早期胚胎、某些特定时期或特定组织来源的神经细胞、免疫细胞等,因此,大家要理性看待低细胞量建库哦,不是所有材料都值得用菲沙基因的低起始量Hi-C建库方法哦~


        换句话说,除了以上来源十分有限的特殊样品,您想给多少材料就给多少,都行,您说了算,有自信,就是这么任性!



配图来源于网络/侵删




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