16S rDNA基因长度约为1.5kb，包含保守区和高变区，保守区在菌种间差异不大，可反映物种间的亲缘关系，高变区具有种属特异性，根据物种亲缘关系不同而有一定的差异，因此16S rDNA已经广泛应用于菌种鉴定和系统发生学研究。

        传统扩增子测序仅针对单个或连续的两到三个可变区进行分析，而基于三代测序平台PacBio的全长16S 扩增子测序可获取16S rDNA全长序列，突破了二代测序读长较短的局限性，提高了菌株在种水平的分辨能力。全长扩增子测序能够获得全部变异区域序列信息，不仅能提高物种鉴定的分辨率¹，还能提高样本中微生物组成鉴定的精确性和全面性²，从而更加真实的还原样本中微生物群落结构。

01 送样要求

        DNA：浓度≥10 ng/uL，总量≥200 ng，DNA要有明显主带，无降解，无RNA、蛋白质等杂质污染

        PCR产物：浓度≥50 ng/uL，总量≥600 ng，确保条带单一，无降解，无引物二聚体

04 主要结果展示

        目的：对每个样本／分组进行微生物种类和丰度的注释，可以直观了解微生物的组成和相对丰度，以便分析和探讨在不同样本／分组间优势菌群的差异。

        多样性分析

        目的：图3反映测序数据量的合理性并间接反映样品中物种的丰富程度。图4可展现样本间／组间的微生物组成差异大小。

        统计分析

        目的：使用统计学方法分析寻找组间差异的物种，筛选出具有代表性的biomaker，作为识别不同类群的生物学标识。

        功能预测

        目的：对样本中的微生物群落进行功能预测，为深入了解群落结构和文章发表锦上添花。

05 应用领域

        菲沙基因，从样本提取到生信分析，项目经验丰富，全方位提供微生物测序分析服务，为您解决各种生物学问题，满足您多样化的科研需求！

参考文献

        1: Pootakham W, Mhuantong W, Yoocha T, et al. High resolution profiling of coral-associated bacterial communities using full-length 16S rRNA sequence data from PacBio SMRT sequencing system[J]. Scientific Reports, 2017, 7(1):2774.

        2: Singer, E., Bushnell, B., Coleman-Derr, D., Bowman, B., Bowers, R.M., Levy, A., Gies, E.A., Cheng, J.-F., Copeland, A., Klenk, H.-P., et al. (2016). High-resolution phylogenetic microbial community profiling. ISME J 10, 2020-2032.