Hi-C技术因能获得全基因组序列在空间中的互作信息，被广泛应用于基因组辅助组装和三维结构互作研究中，但其对细胞起始量的要求较高，通常需要百万级别的细胞量。高起始细胞量限制了一些来源有限或比较珍贵的材料，如动物胚胎、神经元、植物根尖、临床组织样本等，因此降低Hi-C所需的起始细胞量愈显必要。

        之前因材料有限无法进行Hi-C的老师们，现在有好消息告诉大家啦，菲沙基因紧跟技术发展趋势及结合市场需求，已成功开发出了低起始量的Hi-C建库方法，5千个细胞即可成功建库！细节且看下文：

        我们以某动物细胞样本（基因组大小780Mb）进行测试，首先对10^6个细胞的常规起始量进行Hi-C建库，并进行小数据量测序评估文库质量，数据质控结果合格，有效数据率高达68%。

        互作热图的结构清晰，如下所示：

02-我们的低起始量测试

        接下来使用相同的材料，以不同的起始量（10^5个、10^4个、5x10³个细胞）分别进行Hi-C建库测试，结果发现小数据量质控结果均合格且数据的重现性非常好。酶切率均在90%以上，有效数据率均达到60%左右。

        这些结果与常规起始量的Hi-C建库结果相当，且互作热图的结构也清晰可见。

       低起始量Hi-C互作热图展示：

低起始量Hi-C互作图谱（10^5个细胞）

低起始量Hi-C互作图谱（10^4个细胞）

低起始量Hi-C互作图谱（5x10³个细胞）

03-我们的低起始量方法与已发表的方法进行结果比较

        我们在进行低起始量Hi-C建库的同时，以相同起始量细胞，采用了已发表的Low input Hi-C方法（Díaz N, et al. Nature Communication, 2018）进行建库，小数据量质控结果如下：

        结果显示：本次实验以相同的起始量，菲沙基因的低起始量Hi-C建库结果明显优于采用Low input Hi-C方法的建库结果。

        5千个细胞起始量不是我们的终点，更低起始量的Hi-C建库正在突破中.........

        与低起始量的研发同步，菲沙基因进行了Hi-C试剂盒（Frasergen Hi-C Kit）的研发，目前各项测试结果显示正常，并且我们使用此试剂盒，对同一个样品进行了低起始量的Hi-C建库，最终小数据量的质控结果也是合格的，这充分说明菲沙基因低细胞量Hi-C建库的方法成熟且结果稳定。

Frasergen Hi-C Kit的数据质控结果

采用Frasergen Hi-C Kit的Hi-C互作图谱（2x10^5个细胞）

04-总   结

        （1）菲沙基因已完成低细胞量Hi-C建库，低至5千个细胞可成功交付！

        （2）更低细胞量（一千个细胞及以下）Hi-C建库正在突破中.........

        （3）菲沙基因Hi-C试剂盒（Frasergen Hi-C Kit）近期也将强势登陆，敬请期待！