随着单细胞测序技术在各领域尤其是医学科研中广泛深入的应用,高水平文章层出不穷,为了帮助广大医学科研工作者快速了解单细胞领域最新研究动态,今天小编汇总了基于单细胞测序技术近期发表的24篇顶刊高分文献,供大家检索、查询。另外,小编挑选几篇文章进行导读,希望可以给您的研究带来新思路。
文献一
文章题目:Developmental dynamics of two bipotent thymic epithelial progenitor types
中文题目:两种双能胸腺上皮祖细胞类型的发育动力学
发表期刊:Nature
影响因子:49.96
摘要:
胸腺中T细胞发育取决于器官型胸腺上皮微环境,并且在细胞免疫中发挥重要作用。在早期发育过程中,胸腺会快速生长且产生大量T细胞,随着年龄增长胸腺上皮细胞功能逐渐减弱并伴随着T细胞减少。单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 揭示了幼鼠和成年小鼠胸腺上皮细胞的异质性。然而,产前和产后上皮祖细胞的特性和发育动态仍未得到解决。在这里,研究者结合scRNA-seq和CRISPR-Cas9细胞条形码系统两种技术,以确定小鼠胸腺上皮细胞随时间的定性和定量变化。这种双重方法能够确定两个主要的祖细胞群:偏向于皮质上皮的早期双能祖细胞类型和偏向于髓质上皮的出生后双能祖细胞群。进一步证实Fgf7的持续自分泌导致胸腺微环境的持续扩张,但并不会耗尽上皮祖细胞池,这表明了一种调节胸腺生成活性程度的策略。
文献二
文章题目:The Tabula Sapiens: A multiple-organ, single-cell transcriptomic atlas of humans
中文题目:Tabula Sapiens绘制人类多器官单细胞转录组图谱
发表期刊:Science
影响因子:47.72
摘要:
使用单细胞转录组测序对细胞类型进行分子表征的技术正在彻底改变细胞生物学,并使人们对人体器官的生理学有了新的认识。研究者创建了一个人类参考图谱,其中包含来自24个不同组织和器官的近500,000个细胞,并且许多组织和器官来自同一供体。该图谱能够对400多种细胞类型在组织中的分布以及基因表达的组织特异性变异进行分子表征。使用来自单个供体的多个组织能够识别组织之间T细胞的克隆分布,识别B细胞中的组织特异性突变率,以及分析细胞周期状态和跨组织共享细胞类型的增殖潜力。并分析了个体内部组织细胞类型中RNA分子特异性剪接。
文献三
文章题目:Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays
中文题目:使用DNA纳米阵列技术绘制小鼠器官发生时空转录组图谱
发表期刊:Cell
影响因子:41.58
摘要:
空间转录组技术是研究复杂生物过程(如哺乳动物胚胎发生)较前沿的技术。然而,当前方法的分辨率、基因捕获和视野之间的不平衡阻碍了它们系统地应用于分析相对较大和三维的妊娠中期和晚期胚胎。在这里,研究者结合了DNA纳米球 (DNB) 模式阵列和原位RNA捕获技术,创建了空间高分辨率组学测序 (Stereo-seq)。应用Stereo-seq生成小鼠器官发生时空转录组图谱(MOSTA),它以高分辨率和高灵敏度绘制小鼠器官发生过程中转录变异的动力学和方向性。使用这些信息来深入了解空间细胞异质性和细胞命运规范在发育组织中的分子基础。全景图谱将有助于深入调查有关哺乳动物正常和异常发育的长期问题。
文献四
文章题目:Mapping the developing human immune system across organs
中文题目:绘制跨器官发育中的人体免疫系统
发表期刊:Science
影响因子:47.72
摘要:
单细胞基因组学研究已经解码了几种人类产前器官免疫细胞的组成,但在跨组织免疫系统发育方面受到限制。研究者结合单细胞RNA测序、免疫组库测序和空间转录组学分析了九种产前组织,以重建发育中的人类免疫系统。这揭示了骨髓和淋巴细胞亚群较晚获得免疫效应功能,以及外周组织接种前单核细胞和T细胞状态。此外,研究者发现原代造血器官以外的系统血液和免疫细胞发育,阐明了非常规T细胞的起源。
文献五
文章题目:Gene regulation by gonadal hormone receptors underlies brain sex differences
中文题目:大脑性别差异受性腺激素受体基因调控
发表期刊:Nature
影响因子:49.96
摘要:
雌二醇在许多脊椎动物中建立了神经性别差异并调节成年期的情绪、行为和能量平衡。通常雌二醇通过转录因子雌激素受体-α(ERα) 发挥作用。ERα已在乳腺癌中得到广泛的表征,但ERα的神经元靶标及其与大脑性别差异的关系在很大程度上仍然未知。在这里,研究者生成了介导社会行为的性二态神经回路中基因组 ERα结合位点的综合图谱。结果表明ERα通过两种机制调控小鼠大脑的性别分化:建立两种雄性偏向的神经元类型和激活持续雄性偏向基因表达程序。总的来说,基因表达的性别差异是由神经元类固醇受体的激素激活定义的。研究者确定的分子靶点可能是雌二醇对大脑发育、行为和疾病影响的基础。
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