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常见问题

Q1:对于宏基因组项目,怎么排除宿主污染?

    (1)取样时,尽量不要取靠近组织的部位;

    (2)提取的时候采用相应的试剂盒;

    (3)若有参考基因组,可通过比对分析去除宿主基因组污染。


Q2:如果存在较大的宿主的污染,且没有宿主基因组的参考序列可以进行宏基因组测序吗?

    不可以,如果宿主的DNA包含大量的环境DNA,测序之后,会存在严重的污染,暂无已知宿主基因组的序列来进行比对去污染,会影响后续结果分析的准确性,且可用的数据量会很少;但是如果在提取的过程,宿主基因组的污染的量较少,后期的数据分析暂可忽略污染。


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