Q1：代谢组取样一般遵循那些原则？
代表性和一致性：实验组与对照组样本在取材部位、时间、处理过程等方面尽可能保持一致，从而保证实验的可信度。
迅速性原则：在采集、制备、贮存、运输过程中应尽可能地做到迅速，最大限度的缩短样本从采集到实验的时间。
低温原则：样本离体后如有分离步骤应在4℃或冰上等低温条件下进行，并立即置于液氮、干冰或-80℃冰箱中，以免样本产生进一步代谢活动。
Q2：代谢组设置多少生物学重复最好？
临床样本N≥30；动物样本N≥10；细胞样本N≥8；植物样本N≥8；微生物样本N≥8（至少为6个重复）。
Q3：转录组通常使用3个重复，与有更多重复的代谢组分析时要注意什么？
转录组通常为3个生物学重复，与代谢组进行关联分析时注意样本对应，有以下几种情况：
（1）转录组与代谢组均作8个以上生物学重复，样本一一对应；
（2）转录组为3个生物学重复，代谢组为8个生物学重复，在做关联分析时默认与转录组的样本相同，若需要代谢组数据均利用上，需提前备注，将代谢组的数据均一化处理再与转录组的数据进行关联分析（均一化处理由于代谢组样本个体差异较大，会屏蔽掉一些差异）。
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