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1、sRNA筛选

    对各样品的clean reads,筛选一定长度范围内的sRNA来进行后续分析。


2、sRNA分类注释

    统计分别比对到已知miRNA、ncRNA、repeat、novel miRNA和基因exon、intron区域的注释比例,绘制饼图。


3、sRNA表达水平分析

    对不同样品的sRNA的TPM密度分布进行比较,从整体了解不同样品间的TPM分布情况。


4、差异sRNA分析

    通过对不同比较组合的sRNA表达量进行汇总,对差异sRNA进行分析统计。


5、sRNA靶基因功能分析

    预测差异表达的sRNA的靶向mRNA,并对mRNA进行GO、KEGG富集分析,研究调控机制,构建mRNA与sRNA调控网络。


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