流感病毒感染后互作转录组研究
物种：流感病毒-人
样品选择：1918 NS1和1918 NS1-SUMO virus感染的A549细胞：Mock,未感染的人体细胞
测序策略：Illumina+PacBio
研究结果：
1、IAV 1918 NS1中独特的C-terminal
NS1的修饰（SUMOylation,sumo化）由SUMO-解聚酶类控制，由于细胞提取物中NEM被过滤掉(N-乙基马来酰亚胺)，NS1修饰缺失。本研究发现，来自流感病毒1918 的NS1的 C-terminal被SUMO化，这种修饰发生PDZBD中的嵌入一致性序列，修饰后的NS1结构域较短，存在于蛋白质的非结构化区域，可转移到其他底物上进行SUMO结合。这个结构域称为SUPSLIM结构域或SUP肽结构域。
IAV 1918 NS1在其独特的C-terminal区域内被SUMO化
2、NS1的SUMOylation通过干扰RNAPII的终止，增强对宿主转录反应的抑制
IAV1918感染引起宿主细胞转录调控：宿主细胞内全基因组范围内解除（RNA聚合酶II）RNAPII终止，行为依赖NS1的表达，通过 NS1 SUP的SUMOylation进行控制。
NS1的SUMOylation诱导组装并增强普遍存在的RNAPII终止
3、RNAPII贯穿转录机制
流感病毒感染宿主细胞，在受影响的基因中，NS1-SUMO感染在产生内含子保留和RNAPII贯穿方面作用强于NS1感染，即使是poly(a)转录本也是如此。RNA seq及iso-seq数据表明宿主活跃基因下调过程中的RNAPII贯穿转录是由于干扰3′端裂和终止,进而导致感染过程中剪切拼接延迟引起的。
RNAPII贯穿与拼接缺陷的关系
研究结论：
甲型流感病毒(IAV)感染可诱发活跃宿主基因的3’末端及贯穿基因外部区域的RNA聚合酶II (RNAPII)的全部转录缺陷。RNAPII转录缺陷引起的rna的异常表达(3’扩展和宿主基因融合),导致生理水平转录的整体下调，从而影响抗病毒响应和毒力反应。
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