circRNA调节帕金森病氧化应激的新机制
该研究通过RNA-seq比较帕金森病（PD）小鼠模型和野生型小鼠之间差异表达的circRNAs，并利用RT-qPCR证实circSV2b在PD小鼠中下调。然后，在体内进行功能实验，探索circSV2b在PD中的作用。在体外进行功能实验机制研究，包括双荧光素酶信号、FISH、RNA免疫沉淀、RNA pull-down、基因编辑和CUT & Tag实验，证实circSV2b直接竞争性结合miR-5107-5p，减轻了对Foxk1靶基因的抑制，进而正向调控Akt1转录。在体内，机制分析表明，circSV2b过表达通过ceRNA-Akt1轴抵抗氧化应激损伤。总之，该研究发现，miR-5107-5p-Foxk1-Akt1轴可能是circSV2b过表达治疗PD的关键靶点，并强调了circSV2b在血清外泌体中的显著变化。circSV2b可能是PD诊断和治疗的新型生物标志物。
CUT&Tag发现Foxk1是Akt1的一个转录因子(Huang H, et al.2022. Science Advances)
R-loop依赖的启动子近端转录早期终止维持基因组稳定性
该研究首先通过蛋白质质谱分析发现，转录早期终止因子INTAC与单链DNA识别因子SOSS有强烈的相互作用，形成SOSS-INTAC复合物。然后通过生物化学和CUT&Tag等方法证明，SOSS-INTAC复合物主要结合在基因的启动子区域，依赖于R-loop结构中的单链DNA。接着通过功能实验表明，SOSS-INTAC复合物通过其RNA核酸内切酶作用，切割新生的RNA，导致转录早期终止。最后通过细胞生物学和分子遗传学的方法揭示，SOSS-INTAC复合物与RNA核酸外切酶exosome和XRN2协同，防止R-loop的过度积累，从而保护基因组免受R-loop诱导的DNA损伤。该研究还发现，SOSS-INTAC复合物在细胞内以生物大分子凝聚体的形式存在，并且这种凝聚体被破坏后会显著影响SOSS-INTAC调控R-loops和基因组稳定性的能力。
SOSS-INTAC调控R-loops水平（Xu C, et al. 2023. Nature.）
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