ATAC-seq技术简介
ATAC-seq技术的主要实验流程
① 收集细胞或组织,制备细胞悬液;
② 裂解细胞后,加入Tn5转座酶,对处于开放状态的DNA进行酶切;
③ 回收酶切下来的DNA片段,进行二代建库测序。
核小体连接致密的地方,Tn5转座酶不能进入,而松散的开放区域,转座酶能够进入切割下裸露的DNA,并同时连接上特异的adapters。分离纯化出连接上adapters的DNA片段,用于二代测序。因此,通过ATAC-seq得到的是全基因组上处于开放状态的染色质区域。
ATAC-seq技术的主要应用
① 获得在特定时空下基因组中所有处于开放状态的序列,分析调控元件。