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技术领域


Hi-C技术简介


    Hi-C是高通量染色体构象捕获(High-throughput Chromosome Conformation Capture, Hi-C)技术的简称,是由美国Job Dekker研究团队于2009年开发,最初用于捕获全基因组范围内所有的染色质内和染色质之间的空间互作信息,经过近几年的飞速发展,现已应用于基因表达的空间调控机制研究、构建染色体水平参考基因组、构建单体型图谱等方向。在后基因组时代,基因组学研究已全面进入3D时代。


Hi-C技术的实验流程



① 使用甲醛处理细胞,将DNA与蛋白交联,固定DNA的构象;


② 裂解细胞后,用限制性内切酶处理交联的DNA,产生粘性末端;


③ 末端补平修复,并同时引入生物素,标记寡核苷酸末端;


④ 使用DNA连接酶连接临近的DNA片段;


⑤ 蛋白酶消化解除与DNA的交联状态,纯化DNA并打断至长度为300~500bp的片段;


⑥亲和素磁珠捕获标记的DNA ,进行二代建库测序。


    通过上述实验流程,再基于生物信息学数据分析,Hi-C技术能够获得全基因组范围内所有序列间的互作信息,从而构建染色体水平参考基因组,揭示基因的空间远程调控机制,重构染色质三维空间结构模型。


Hi-C技术的主要应用


① 构建染色体水平参考基因组


② 构建全基因组互作网络,研究基因组三维结构及基因表达的空间调控机制


③ 构建基因组单体型图谱


技术流程




菲沙基因三维基因组技术服务优势


先进的实验平台:国内率先开展三维基因组研究,实验技术体系先进成熟。


专业的数据分析:开发了详细的数据分析流程,提供专业细致的图文结果。


丰富的项目经验开展的三维项目涵盖了细菌、古菌、真菌、软体动物、鱼类、寄生虫、哺乳动物、各类植物、血液、人类组织及细胞系等。研究成果发表在NatureCell Research等高水平期刊。


完善的服务流程:项目调研、实验开展、数据分析、结果交付、报告解读,全程为您贴心服务!




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