全长扩增子测序
三代平台的polymerase read的平均读长为50Kb以上,16S rDNA长度大约为1500bp左右,该平台可以成功测序获得16S/18S/ITS的全长序列,获得全部变异区域序列信息不仅能提高物种鉴定的分辨率,还能提高样本中微生物组成鉴定的精确度,从而能更加真实的还原样本中微生物的群落结构。
菲沙优势
高通量--能同时分析群落中所有的微生物;高数据质量--采用PacBio的CCS模式,对序列自我矫正,数据一致性准确率高;高分辨率--分析16SrDNA全长,分类精准到种。
适用范围
① 医学领域:代谢病、肿瘤癌症等;
② 畜牧领域:肠道、瘤胃(如产甲烷菌类群)与动物健康/营养消化研究等;
③ 农业领域:根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等;
④ 环境领域:雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境等;
⑤ 生物能源:特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的开发;
⑥ 特殊极端环境:极端环境条件下的微生物类群研究。